Заготовка биотоплива начинается осенью, чтобы оно не сгорело раньше времени. Укладка происходит штабелями, усердно утрамбовывают и сверху утепляют торфом или соломой. При укладке топлива в штабель заранее смешивают с бытовыми отходами или древесными, добавляя азотистое питательное вещество.

Весною лучше всего подойдет заранее подготовленное биотопливо. При подготовке его для начала перемешивают, поливают водой, а навозную жижу укладывают в штабель без утрамбовки.  После этого внутрь штабеля укладывают горячие угли или камни.

Только через несколько дней будет готово биотопливо для обогрева  теплиц. К этому времени его градус увеличится до 50 – 60 градусов по Цельсию, и начнет гореть. Очень важно знать, что температура биотоплива внутри штабеля достигнет максимального значения только через неделю.  В остальные дни постепенно температура будет убывать. Средняя продолжительность выделения топлива примерно 40 – 60 дней, порой горение может продолжаться до 2 – 3 месяцев.